Basta seguir os procedimentos abaixo:

1) Clicar com o botão direito (ou ⌘+click) no ícone do aplicativo instalador do Lion e selecionar a opção “Mostrar Conteúdo do Pacote”
2) Abrir a pasta Contents, e dentro dela abrir a pasta SharedSupport. Dentro dela você encontrará a imagem do seu disco (ou pen drive) de instalação do Lion, com o nome de InstallESD.dmg
3) Copiar o InstallESD.dmg para o seu desktop ou outra pasta de sua preferência.
4) Plugar  um pen drive de 4GB ou mais cujo conteúdo possa ser apagado.
5) Com o Utilitário de Disco, criar no pen drive uma partição (de pelo menos 4GB) no formato que permite que ele seja bootável em um Mac (GUID).
6) Ainda no Utilitário de Disco, usar a aba Restaurar para transferir para a sua nova partição no pen drive a cópia do InstallESD.dmg que você criou no passo 3 – é normal este passo demorar vários minutos.

Para dar boot pelo pen drive, basta ligar o Mac com o pen drive conectado e a tecla Option apertada, respondendo adequadamente no menu que perguntará por qual dispositivo você deseja inicializar.

Pronto! Agora você pode realizar sua instalação limpa do Lion.

Obs: Procedimento testado na versão GM (Gold Master)

Lembrando: Faça por conta e risco.

Fonte: BR MAC.